Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNIP3Q9Y2W7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNIP3Q9Y2W7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNIP3Q9Y2W7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms