Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
YBX2Q9Y2T7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
YBX2Q9Y2T7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms