Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSX2IPQ9Y2D8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSX2IPQ9Y2D8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSX2IPQ9Y2D8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSX2IPQ9Y2D8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms