Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BTRCQ9Y297 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BTRCQ9Y297 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BTRCQ9Y297 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms