Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms