Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLEC11AQ9Y240 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLEC11AQ9Y240 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLEC11AQ9Y240 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLEC11AQ9Y240 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms