Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GNEQ9Y223 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GNEQ9Y223 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNEQ9Y223 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms