Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FZD1Q9UP38 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FZD1Q9UP38 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FZD1Q9UP38 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FZD1Q9UP38 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms