Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHA7Q9UN72 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHA7Q9UN72 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHA7Q9UN72 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHA7Q9UN72 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHA7Q9UN72 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHA7Q9UN72 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHA7Q9UN72 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHA7Q9UN72 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms