Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX12Q9UMY4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX12Q9UMY4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX12Q9UMY4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX12Q9UMY4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms