Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP18Q9UMW8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP18Q9UMW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP18Q9UMW8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
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