Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS0

NFU1, NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFU1Q9UMS0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFU1Q9UMS0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFU1Q9UMS0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms