Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN11Q9UMQ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN11Q9UMQ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPN11Q9UMQ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN11Q9UMQ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms