Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP17Q9ULZ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP17Q9ULZ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP17Q9ULZ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms