Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT6Q9ULM6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT6Q9ULM6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT6Q9ULM6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms