Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV3

ACIN1, Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACIN1Q9UKV3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ACIN1Q9UKV3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ACIN1Q9UKV3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ACIN1Q9UKV3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ACIN1Q9UKV3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ACIN1Q9UKV3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ACIN1Q9UKV3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ACIN1Q9UKV3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ACIN1Q9UKV3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ACIN1Q9UKV3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ACIN1Q9UKV3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ACIN1Q9UKV3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ACIN1Q9UKV3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ACIN1Q9UKV3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms