Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO4Q9UKT5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO4Q9UKT5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
FBXO4Q9UKT5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO4Q9UKT5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms