Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MBD1Q9UIS9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MBD1Q9UIS9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MBD1Q9UIS9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms