Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms