Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
DNAJB4Q9UDY4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DNAJB4Q9UDY4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJB4Q9UDY4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB4Q9UDY4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 340.6 ms