Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EIF3KQ9UBQ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EIF3KQ9UBQ5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms