Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN3Q9P232 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN3Q9P232 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN3Q9P232 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN3Q9P232 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms