Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MSRB1Q9NZV6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MSRB1Q9NZV6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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