Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF12Q9NZN5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ARHGEF12Q9NZN5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF12Q9NZN5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.4 ms