Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDE1Q9NZC3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GDE1Q9NZC3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDE1Q9NZC3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDE1Q9NZC3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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