Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD3Q9NY59 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD3Q9NY59 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD3Q9NY59 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD3Q9NY59 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMPD3Q9NY59 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD3Q9NY59 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD3Q9NY59 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD3Q9NY59 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD3Q9NY59 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMPD3Q9NY59 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD3Q9NY59 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMPD3Q9NY59 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMPD3Q9NY59 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms