Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD1Q9NXG2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms