Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJC28Q9NX36 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC28Q9NX36 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms