Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMBRD1Q9NUN5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBRD1Q9NUN5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms