Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCP11L1Q9NUJ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TCP11L1Q9NUJ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCP11L1Q9NUJ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCP11L1Q9NUJ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms