Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
ATG3Q9NT62 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATG3Q9NT62 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ATG3Q9NT62 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATG3Q9NT62 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms