Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RRP7BPQ9NSQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RRP7BPQ9NSQ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
RRP7BPQ9NSQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
RRP7BPQ9NSQ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms