Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A13Q9NSD5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A13Q9NSD5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A13Q9NSD5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms