Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT82Q9NSB4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT82Q9NSB4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT82Q9NSB4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms