Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHPT1Q9NRX4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHPT1Q9NRX4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHPT1Q9NRX4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms