Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDC42SE2Q9NRR3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDC42SE2Q9NRR3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms