Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TULP4Q9NRJ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TULP4Q9NRJ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TULP4Q9NRJ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms