Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ2

GSN-AS1, Putative uncharacterized protein GSN-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSN-AS1Q9NRJ2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GSN-AS1Q9NRJ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GSN-AS1Q9NRJ2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSN-AS1Q9NRJ2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSN-AS1Q9NRJ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSN-AS1Q9NRJ2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSN-AS1Q9NRJ2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GSN-AS1Q9NRJ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSN-AS1Q9NRJ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSN-AS1Q9NRJ2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSN-AS1Q9NRJ2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSN-AS1Q9NRJ2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSN-AS1Q9NRJ2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSN-AS1Q9NRJ2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GSN-AS1Q9NRJ2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms