Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C8orf4Q9NR00 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C8orf4Q9NR00 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C8orf4Q9NR00 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms