Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYLDQ9NQC7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CYLDQ9NQC7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CYLDQ9NQC7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CYLDQ9NQC7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms