Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4BQ9NPR2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4BQ9NPR2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4BQ9NPR2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4BQ9NPR2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms