Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TIMMDC1Q9NPL8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIMMDC1Q9NPL8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms