Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREM1Q9NP99 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms