Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF12AQ9NP84 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF12AQ9NP84 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF12AQ9NP84 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms