Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP29Q9HBJ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP29Q9HBJ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP29Q9HBJ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP29Q9HBJ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms