Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ELP3Q9H9T3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ELP3Q9H9T3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ELP3Q9H9T3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ELP3Q9H9T3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms