Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNDIG1Q9H7V2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNDIG1Q9H7V2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.4 ms