Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FNDC4Q9H6D8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FNDC4Q9H6D8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FNDC4Q9H6D8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms