Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLMPQ9H6B4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLMPQ9H6B4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms