Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOJQ9H4E5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOJQ9H4E5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOJQ9H4E5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms